FluidicLab微流控实验室:制备mRNA-LNP中常见问题处理缩略图

FluidicLab微流控实验室:制备mRNA-LNP中常见问题处理

一、使用LNP-B0芯片按照Moderna或者Pfizer的公开配方制备mRNA-LNP,DLS测量出现两个峰,一个小于100 nm,另外一个峰大于1000 nm的峰,并且PDI大于0.2以上,应该如何处理?

答:出现这种情况一般有三个原因:

1. 进行DLS测量时测量杯壁上有划痕,对于多次反复重复使用,并反复用吸水纸擦拭的测量杯,该现象更加明显。当激光打在测量杯表面时,测量杯表面会发生激光散射,造成测量有大颗粒的假象。

2. 总流速太快,水和乙醇快速混合时会有气泡产生,测量时溶液中有微气泡残余。

3. 30倍稀释后的LNP粒子浓度太低,背景信号占比比较高,造成PDI过大。

处理方法:

1. 一般不需要做额外处理,只要小于100 nm的峰形正常,经过超滤浓缩后的LNP重新测量,大于1000 nn的峰基本上就会消失,PDI会降低到0.1左右,不会影响后续实验。

2. 如果该情况继续出现的话,降低总流速到3-4 ml/min,观察是否有改善。

二、 制备的LNP粒径和PDI均比较正常,但是转染细胞后效率很差,应该如何处理?

答:一般使用包含GFP mRNA的LNP转染细胞后两天内即可观察到明显的荧光,以96孔板为例,单孔转染对应1 ug mRNA的LNP(*低可降低到0.1 ug), 转染效率普遍在70%以上,如果没有观察到明显的荧光,建议转染细胞时使用无血清培养基。加入血清会大大降低转染效率。

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实验方案:微流控混合方式制备mRNA脂质纳米颗粒(LNP)

实验结果:使用MC3制备LNP参考结果_1缩略图

实验结果:使用MC3制备LNP参考结果_1

试剂

MC38 mM
PEG20000.24 mM
DSPC1.6 mM
Cholesterol6.16 mM
以上试剂均来自于IVT

制备设备

LNP制备系统(科研级)

实验方法

参考实验方案:微流控混合方式制备mRNA脂质纳米颗粒(LNP)

测试设备

Nicomp® Nano DLS/ZLS Systems

测试条件

Run Time = 0 Hr 1 Min 35 Sec

Wavelength = 635.0 nm

Count Rate = 320 KHz

Temperature = 23 deg C

Channel #1 =55.7 K

Viscosity = 0.933 cp

Channel Width = 10.0 uSec

Index of Ref. = 1.333

结果小结

实验结果:使用MC3制备LNP参考结果_1插图

总流速:4 ml 流速比:1 : 3

实验结果:使用MC3制备LNP参考结果_1插图1

总流速:6 ml 流速比:1 : 3

实验结果:使用MC3制备LNP参考结果_1插图2

总流速:8 ml 流速比:1 : 3

实验结果:使用MC3制备LNP参考结果_1插图3

总流速:10 ml 流速比:1 : 3

实验结果:使用MC3制备LNP参考结果_1插图4

总流速:12 ml 流速比:1 : 3

实验结果:使用MC3制备LNP参考结果_1插图5

总流速:12 ml 流速比:1 : 3 包裹GFP mRNA

实验结果:使用MC3制备LNP参考结果_1插图6
实验方案:微流控混合方式制备mRNA脂质纳米颗粒(LNP)缩略图

实验方案:微流控混合方式制备mRNA脂质纳米颗粒(LNP)

实验目的:

参照Moderna和BioNtech的新冠疫苗配方,以MC3和SM102为主要脂质,制备包载mRNA的脂质纳米颗粒(LNP)。

实验原理:

MC3和SM102是两种可解离脂质,在酸性条件下可质子化形成阳离子脂质,通过静电作用于带负电的mRNA结合,形成载有mRNA的脂质纳米颗粒(lipid nanoparticles, LNPs)。在本实验中采用微流控混合法,让脂质溶液与和mRNA溶液在微混合器中充分、迅速的形成粒径均一的LNP。由于脂质溶解于乙醇中,核酸溶解于酸性缓冲液中,因此需要透析或者超滤去除残余的乙醇并将溶液体系置换至PBS中。

实验材料:

实验方案:微流控混合方式制备mRNA脂质纳米颗粒(LNP)插图
实验方案:微流控混合方式制备mRNA脂质纳米颗粒(LNP)插图1

实验步骤:

1.配制脂质-乙醇溶液:

LNP 的成分与分子量见下表:

实验方案:微流控混合方式制备mRNA脂质纳米颗粒(LNP)插图2
百分比来源于前期研究,并不一定与onpattro和mRNA-1273相同。

所有成分总浓度配置成12 mM(约7.5 mg/ml)的浓度。如果需要摸索磷脂对LNP Final粒径的影响条件,可以配制以下浓度:8 mM(约5 mg/ml)、12 mM(约7.5 mg/ml)和16 mM(约10 mg/ml)。

2.计算mRNA浓度:

根据N/P=6,FRR=3计算所需RNA浓度。

RNA的碱基的平均分子量为324,每个碱基携带1个磷酸,因此RNA中的含磷量为3.1 nmol/μg.

计算氮磷比时仅计算主要脂质中的氮原子数,因此每摩尔混合脂质中含有0.5摩尔N。

实验方案:微流控混合方式制备mRNA脂质纳米颗粒(LNP)插图3
实验方案:微流控混合方式制备mRNA脂质纳米颗粒(LNP)插图4

3.配制mRNA-柠檬酸缓冲液:

使用超纯水分别配制100 mM的柠檬酸(分子量:210.14,称取1.05 g)和柠檬酸钠(分子量:294.10,称取1.47 g)溶液各50 ml。

取33.0 ml柠檬酸溶液和17.0 ml柠檬酸钠溶液,混合后加入DEPC,静置30分钟后高压灭菌去除DEPC,灭菌后使用DEPC水定容至100 ml即得50 mM pH=4的柠檬酸缓冲液。

将mRNA测定浓度后根据脂质浓度使用柠檬酸缓冲液稀释至所需浓度。

4.微流控混合:

一、装配微流控混合芯片和夹具:

实验方案:微流控混合方式制备mRNA脂质纳米颗粒(LNP)插图5
步骤一、如图1所示,打开夹具。
实验方案:微流控混合方式制备mRNA脂质纳米颗粒(LNP)插图6
步骤二、如图2所示,装入LNP混合芯片,注意芯片开口方向( FluidicLab logo正面),芯片开口和夹具开口对准,芯片要完全陷入卡槽中。
实验方案:微流控混合方式制备mRNA脂质纳米颗粒(LNP)插图7
步骤三、如图3所示,合上卡扣,芯片装载完成。
实验方案:微流控混合方式制备mRNA脂质纳米颗粒(LNP)插图8
如图4所示,将夹具放置在托盘上,托盘下放置废液管和样品收集管。将磷脂溶液和mRNA溶液导入,即可制作LNP。

二、预冲洗管路和微混合芯片:

预冲洗保证微混合芯片内部已经预先充满乙醇和柠檬酸缓冲液。

1. 将无水乙醇和柠檬酸缓冲液通过0.22微米微孔滤膜过滤。

2.将无水乙醇吸入3 ml注射器中(吸入体积约0.7 ml),将柠檬酸缓冲液吸入3 ml注射器中(吸入体积约2.1 ml),并排出注射器中的空气。在注射器上标注“乙醇”和“缓冲液”。

3.分别将“乙醇”和“缓冲液”注射器和样品导入管连接,并安装在注射泵上,如下图所示。

实验方案:微流控混合方式制备mRNA脂质纳米颗粒(LNP)插图9

组装完成的注射泵和芯片夹具如图所示:

实验方案:微流控混合方式制备mRNA脂质纳米颗粒(LNP)插图10

4.按照以下步骤选择合适的注射器型号,注射体积和流速(以LNP-B1为例,总流速12 ml/min)。

实验方案:微流控混合方式制备mRNA脂质纳米颗粒(LNP)插图11
  1. 将废液管放置在样品流出管下,收集流出的废液。
  2. 点击开始,开始冲洗管路和芯片。
实验方案:微流控混合方式制备mRNA脂质纳米颗粒(LNP)插图12

三、微流控混合制备LNP:

1.分别将分别将脂质-乙醇溶液和mRNA-柠檬酸缓冲液通过0.22微米滤膜过滤。

2.将脂质-乙醇溶液吸入3 ml注射器中(根据需要,至少需要吸入0.5 ml),将mRNA-柠檬酸缓冲液吸入3 ml注射器中(至少吸入1.5 ml),并排出注射器中的空气。

3.将注射器出口和样品导入管连接,并固定在注射泵上。

4.用户可根据具体需要来调整注射泵的流速和混合体积。推荐起始设定如下:

实验方案:微流控混合方式制备mRNA脂质纳米颗粒(LNP)插图13

5.点击运行,观察流出管流速稳定后(一般需要丢弃前100-200微升液体),用收集管收集流出的液体。一般在注射结束前1-2秒停止收集,丢弃*后1-2秒流出的液体(若配备自动切换前后废的装置,则需要在软件中设置)。

 

四、透析(或者超滤)与储存:

透析:

1.样品收集后,立即用30倍体积的PBS将乙醇浓度稀释到1%以下。

2.使用动态光散射仪测定LNP粒径和均一度。正常结果如下图所示:

实验方案:微流控混合方式制备mRNA脂质纳米颗粒(LNP)插图14

3.制备后放入透析管(Slide-A-Lyzer™ MINI Dialysis Device, 10K MWCO, 0.5 mL)中加入14 ml PBS在摇床上透析,2小时后换液,放置摇床直至18小时后透析结束。一般透析或者超滤后粒径和PDI均会略微增大。

4.保存于含有2%蔗糖的PBS,-80℃冻存。

超滤:

1.样品收集后,立即用30倍体积的PBS将乙醇浓度稀释到1%以下。

2.使用Milipore 30 KD超滤管,3000 g离心20分钟进行超滤。

3.保存于含有2%蔗糖的PBS,-80℃冻存。

实验名称:LNP包封率测定

实验目的:

对制备的LNP包封mRNA的效果进行测定。

实验原理:

Quant-iT™RiboGreen®RNA试剂是一种超灵敏的荧光核酸染色剂,可检测溶液中1-200 ng的核酸,这种核酸染料无法透过LNP,因此只有游离的未被LNP包载的核酸可以被结合。Triton-100作为一种表面活性剂常被用做破乳剂,使用1%的Triton-100处理获得的LNP-mRNA可以使包载的核酸释放,得到总核酸量。通过计算破乳前后核酸量的差异得到载药量,再除以总核酸量即可得到包封率,即:

包封率(%)=(破乳后定量-破乳前定量)/破乳后定量

实验材料:

Quant-iT™ RiboGreen™ RNA 检测试剂盒(Thermo Fisher,R11490)

Triton™ X-100  (SIGMA-ALDRICH,T8787-100ML)

DEPC水

CellCarrier-96 Ultra Microplates ( PerkinElmer,6055308)   

实验步骤:

1.LNP制备

见LNP制备流程。

2.试剂准备(详细参见说明书):

将20xTE用DEPC水稀释至1x;

用稀释好的1XTE稀释试剂盒中的标准品,稀释成2 μg/mL及100 ng/mL两种终浓度;

用1xTE稀释试剂盒中的QuantiT™ RiboGreen® Reagen,稀释成200倍及2000倍两种终浓度;

按照下表在CellCarrier-96 Ultra Microplates中加入以下试剂,做复孔:

High range

实验方案:微流控混合方式制备mRNA脂质纳米颗粒(LNP)插图15

Low range

实验方案:微流控混合方式制备mRNA脂质纳米颗粒(LNP)插图16

3.LNP破乳

      将Triton-100用1xTE稀释到2%,取100 μl加入CellCarrier-96 Ultra Microplates,加入1 μl制备好的LNP,处理5分钟,加入100 μl 200-fold diluted quant-iT RiboGreen Reagent。

4.LNP游离核酸测定

在CellCarrier-96 Ultra Microplates中加入100ul1xTE,取1μl制备好的LNP加进去,混匀,加入100 μl l2000-fold diluted quant-iT RiboGreen Reagent。

5.读板      

     使用SPARK读取荧光强度,激发光设置为480 nm,发射光为520 nm

6.数据处理

1) 标曲制备

实验方案:微流控混合方式制备mRNA脂质纳米颗粒(LNP)插图17

2) 样品定量

载药量=破乳后读值-破乳前读值

包封率(%)=载药量/破乳后读值

 

Fluidiclab LNP制备系统(科研级)使用操作视频演示

 

 

应用微流控技术生成载药型脂质体缩略图

应用微流控技术生成载药型脂质体

脂质体( liposome) 是由磷脂分散在水中时形成的双分子层类球状闭合囊泡,其外壳为磷脂双分子层,内部为水相包裹物。脂质体的直径为几十纳米至数百微米的。常用的载药型脂质体种类如下:
应用微流控技术生成载药型脂质体插图

 脂质体与生物膜有较大的相似性以及组织相融性,在宿主体内可生物降解,无免疫原性;易于被组织吸收,对机体无毒或毒副作用小;有较高的靶向性。由于其独特的性质,脂质体作为载体可以包封和输送DNA/RNA、蛋白质、化学分子或其他功能物质。

脂质体作为药物载体,既具有缓释药物和降低药物毒性功能,又可以提高药物稳定性和对靶向性。而且脂质体载药过程主要为物理过程,不会改变和破坏药物分子结构与活性,且包封的药物可避免体内水解酶的破坏。因此脂质体制备及其作为药物载体的研究。

影响脂质体粒径和单分散性的参数包括脂质体尺寸及分布、磷脂组成、胆固醇含量、荷电性、包裹物性质以及包裹量等。选择合适的脂质体制备方法,可以较好地控制上述因素,从而实现对脂质体性能的控制。

临床应用的脂质体药物载体通常要求尺寸在20 ~ 200 nm 左右,尺寸均一,这种单分散脂质体药物载体可以明显提高药物的生物利用度,避免免疫细胞的清除,减小毒副作用,提高治疗的靶向性。因此制备尺寸均一、大小可控、质量可控的脂质体药物载体对研究药物输送、缓释有着重要的意义。

微流控脂质体制备技术不仅能很好地控制脂质体的尺寸均一性,而且脂质体尺寸大小、药物包封量等都可以通过改变各相流体的流动参数实现精确调控,具有显著优势。常用的微流控技术制备脂质体的方法如下:

01、流体聚焦法

流体聚焦是*常见的微流控脂质体制备方法。流体聚焦法,主要是指连续流制备脂质体。在芯片中间通道引入含二肉豆蔻酰磷脂酰胆碱(DMPC)和胆固醇的异丙醇溶液作为有机相,两侧通道引入PBS溶液,当三股流体在主通道聚焦时,脂-醇溶液被两侧水相挤压并扩散至水相形成窄的混合溶剂区。当混合溶剂区醇含量低于脂溶解所需的醇含量,磷脂会自组装形成单层小尺寸球形脂质体。脂质体的大小可通过有机相或水相流体流速调控在100-300 nm,单分散性好。

应用微流控技术生成载药型脂质体插图1

 图1、 流动聚焦芯片中的乙醇相和水相。中间流道为乙醇相,上下两侧流道为水相。

流体聚焦制备脂质体具有以下几点优势:

1. 可以精确地控制边界条件,按照需求调控各种物理参数;
2. 可批量制备脂质体;
3. 脂质体尺寸均一、大小可控;
4. 能获得高的包封率; 

为了更好地控制流体特性和所制备脂质体的尺寸,也可以采用一种五个进口、三个出口的微流控结构,水溶性物质直接被两侧的醇相包封,随后形成包封水溶性物质的脂质体,很大程度上减少了包封物质的浪费。

醇相与水相总流速( TFR) 与流速比(水相/醇相=FRR) 对脂质体制备的具有决定性的影响。当TFR比较小时,改变TFR但保持固定的FRR,对脂质体大小和尺寸分布影响不大;当增大FRR时,脂质体的粒径随之减小。使用流体聚焦微流控芯片,并使用不同链长的磷脂酰胆碱( PC)、胆固醇和双十六烷基磷酸( DCP) 作为制备脂质体的组分,当FRR一定时,TFR的增加会导致脂质体的增大,而且FRR数值越小,脂质体增大越明显。研究表明微流控芯片通道尺寸、深度以及几何形状对制备的脂质体性能没有显著影响,不同的芯片结构、通道尺寸以及流体聚焦模式都可以产生尺寸相似的脂质体。但通道尺寸和深度较大的芯片易于制作和操控,且制备通量更高,有利于实际应用。

通过对三进口流体聚焦型、Y型以及微混合器型等三种不同结构的芯片并从微流体通道尺寸、进口通道之间角度、芯片材料、制备方法等方面的研究发现,脂组分浓度、乙醇含量、脂组成、FR 变化等对制备的脂质体都有很大的影响。脂组分浓度的增加导致制备的脂质体粒径明显增大,而乙醇含量的影响正好相反。中性脂组分制备的脂质体粒径明显大于带正电的脂组分制备的脂质体。增大FR使脂质体的粒径变小。

温度对脂质体尺寸影响*为显著,较高温度制备的脂质体尺寸明显小于室温制备的脂质体。在醇-脂体系中,温度对脂质体的制备影响较大。

虽然二维流体聚焦对制备脂质体的分散性和尺寸大小能*好地控制,但是作为商业化手段来实现脂质体的制备仍然面临制备通量低的问题。基于此,研究者开发了三维同轴聚焦技术。

应用微流控技术生成载药型脂质体插图2

 图2、 (a) 三维流动聚焦脂质体制备设备示意图; (b) 二维流动聚焦与三维流动聚焦对制备脂质体的影响; (c) 三维流动聚焦设备PEEK管内径大小对制备脂质体的影响; (d) 不同FR对脂质体制备的影响。

利用如图2所示结构,使用核-环形毛细管阵列平台形成三维流体聚焦,在连续流状态下直接制备纳米脂质体。由于多个核-环结构毛细管组成阵列,脂质体的制备效率是二维流体聚焦制备方法的10000 倍,且制备的脂质体尺寸可调,呈高度单分散性。这主要是因为在三维流动聚焦装置中,含脂的醇溶液能快速扩散至水相中。图2a是环形毛细管阵列三维流动聚焦设备示意图,中间是一根用于引入脂-醇溶液的窄口PEEK圆形毛细管,窄口毛细管周围是引入水相的玻璃毛细管阵列。在制备脂质体的时候,中间毛细管持续引入的脂-醇溶液在周围玻璃毛细管引入的水相作用下形成三维流体聚焦,并迅速扩散至水溶液中自组装形成脂质体。

02、双乳化微滴法

双乳化微滴法是一种有效制备巨型脂质体的方法。

应用微流控技术生成载药型脂质体插图3

图3、 (a) 双乳化制备脂质体芯片示意图; (b) 中间溶脂有机相中通过界面脱湿过程自发形成脂质体和辛醇液滴; (c) 脂质体和辛醇微滴通过分离孔进行分离。

水-油-水( W / O / W) 双层微乳液滴法已经作为一种高效、方便的技术用于制备单分散的GUV。通常,油相为挥发性的有机溶剂,促使单层脂分布在水-油界面形成双层脂膜,排列成双层微乳,通过溶剂萃取,W / O / W 双层微乳形成脂质体( 如图3b)。Siddharth Deshpande等使用微流控平台产生双层微乳,并自发组装成GUV。 他们使用局部改性的PDMS微流控芯片制备出单分散性和稳定性俱佳的 W / O / W 双层微乳液滴。通过各相流体流量可以方便地控制双层微乳液滴的尺寸,从而得到尺寸均一、分散稳定的双层微乳液滴,进一步得到单分散的巨型脂质体。

微流控液滴法能避免诸如包封率低、非生理性环境和多分散性等难题。微流控液滴具有更大的比表面积,相比较连续流流体聚焦能够更好地控制形成的脂质体的大小和均一性,而且有很高的包封率。但是以微乳为基础的微流控液滴制备方法*大的缺陷就是需要使用与水不相混溶的有机溶剂(包括油残留或表面活性剂),而此类溶剂通常毒性较大,较难从脂质体体系中清除,并且降解活性成分,因此可能导致脂质体有毒, 从而对人体健康产生潜在风险。

03、微混合器法

应用微流控技术生成载药型脂质体插图4

流速是脂质体制备中一个非常关键的影响因素。Maeki 等设计了如图 9 所示的交叉鱼骨形微混合器的微流控芯片结构,并研究了混合器结构不同( 即混合单元数不同)、FR 不同以及醇水溶液汇合处与混合器之间距离不同对制备的脂质体的影响。研究发现混合器混合单元数目和FR大小是制备纳米脂质体的关键因素,FR由小逐渐增加至中等数值时,混合器对纳米脂质体粒径大小的影响比较明显。同时第一个混合单元的位置对于制备纳米脂质体也存在一定的影响。他们推测要形成小粒径纳米脂质体的本质是快速降低乙醇浓度至其临界浓度。利用交叉人字形微混合器结构可以高通量制备由促融脂二油酰基磷脂酰乙醇胺( DOPE) 和阳离子脂(2,3-二油氧基丙基) 三甲基氯化铵( DOTAP ) 组成的单分散阳离子纳米脂质体。制备的阳离子脂质体不仅转染效率高、重复性好,粒径尺寸和分散性则可以通过调节总流速及FR得到很好地控制。