DTT溶解聚丙烯酰胺水凝胶微球( Dissolvable Polyacrylamide Gel Bead)制备服务

基于微液滴的单细胞测序方以其高通量和单细胞的分辨率引发了生物学的一次革命。在微流控单细胞测序技术中,barcode gel beads是其技术的核心。目前常见的用于高通量单细胞测序的barcode gel beads均为聚丙烯酰胺水凝胶微球。

该微球通过二硫键交联形成高分子骨架,在交联体系中存在5’-Acrydite修饰的引物时,引物可以共价结合在微球骨架上,并伴随微球和单细胞包裹在单个微滴中。微球骨架在DTT(二硫苏糖醇)存在时快速发生降解,将微球上交联的引物释放到液滴中,在细胞裂解后和mRNA结合,完成反转录和扩增。

常规兼容10X Genomics体系的微球直径为50-53微米。

DTT溶解聚丙烯酰胺水凝胶微球( Dissolvable Polyacrylamide Gel Bead)制备服务插图图一、固化后的聚丙烯酰胺水凝胶微球

DTT溶解聚丙烯酰胺水凝胶微球( Dissolvable Polyacrylamide Gel Bead)制备服务插图1图二 聚丙烯酰胺水凝胶微球粒径分布。

左:10X barcode gel beads粒径分布 ;                  右:澎赞微球粒径分布